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意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达微小RNA及其靶基因分析


澳门银河注册网站   发布时间: 2019-04-06   信息员:  


意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达微小RNA及其靶基因分析.pdf


作者:郭睿,杜宇,周倪红,刘思亚,熊翠玲,郑燕珍,付中民,徐国钧,王海朋,耿四海,周丁丁,陈大福


:[目的]蜜蜂球囊Ascosphaeraapis(简称球囊菌)是一种特异性侵染蜜蜂幼虫肠道的致死真菌病原RNAmicroRNAmiRNA是一在转录后水平mRNA进行负调控的关键调因子本研究旨在对意大Apismelliferaligustica(简称意)幼虫肠道在球囊菌胁迫后期异表miRNAsDEmiRNAs)及其靶基因进行深入分析为揭DEmiRNAs胁迫应答中的作提供重要信息[方法]smallRNA-seqsRNA-seq技术对正常及球囊菌侵染的意6日龄肠道(分别表示AmCKAmT)进行测序通过相关生物信息学软件DEmiRNAs进行预测分析TargetFinder软件预DEmiRNAs的靶基然后BLast软件对靶基因进GOKEGG数据库的功能注释Cytoscape软件构DEmiRNAs与其mRNAs的调控网茎环实时荧光定PCRStem-loopRT-qPCR验证测序数据的可靠[结果]AmCKAmT序分别得923049610823667条有效序列标;AmCKvsAmT比较组中包15个上调6个下miRNAs分别结35033252个靶基它们可分别注释4039GOterms10499条代谢通路;进一步分析发现调控网络中17DEmiRNAs靶向结116个与丝氨酸酶相关mRNAs14DEmiRNAs靶向结54个与泛素介导的蛋白水解相关mRNAsStem-loopRT-qPCR验证结果显示随机选择4DEmiRNAs(miR-251-XmmiR-9277-ymiR-1672-XmiR4968-y)的表达量变化趋势与测序结果一致表明测序数据真实可信[结论]本研究率先对蜂幼肠道在球囊菌胁迫后期DEmiRNAs及其靶基因进行预测与分提供miRNAs谱和差异表达信息ame-miR927b,miR-429-ymiR-8440-yDEmiRNAs可能参与对丝氨酸白酶的调控和对泛素介导的蛋白水解的调控DEmiRNAs与靶基因之间存在复杂的调控网络关DEmiRNAs可参与到意蜂幼虫肠道与球囊菌间的互作


关键词:意大利蜜蜂;蜜蜂球囊菌;胁迫应答;RNA;免疫防御;靶基


发表信息:昆虫学报,2019,62(01):49-60

  


 
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